Visium HD Spatial Gene Expression
ofrece un descubrimiento espacial completo.
Con una nueva tecnología que combina el análisis de todo el transcriptoma a nivel de célula única, permite una cobertura continua del tejido y ofrece datos de alta calidad mediante una química innovadora y un flujo de trabajo habilitado por Visium CytAssist.
Next-generation slide architecture enables single cell–scale resolution
Los slides de Visium HD Spatial Gene Expression contienen dos áreas de captura de 6.5 x 6.5 mm con una distribución continua de oligonucleótidos en ~11 millones de cuadrados de 2 x 2 µm con barcodes específicos, logrando una resolución espacial a nivel de célula única. Los datos se generan a 2 µm, así como en múltiples tamaños de bin. (Se recomienda iniciar la visualización y análisis con el bin de 8 x 8 µm.)
La exploración intuitiva de datos acelera el descubrimiento
- Puede procesar los datos de expresión génica espacial de Visium HD con imágenes de microscopio de campo claro y de fluorescencia utilizando Space Ranger, un conjunto de pipelines de análisis.
- Además, se puede visualizar y explorar los datos con Loupe Browser y continuar el análisis con la creciente comunidad de herramientas desarrolladas en R y Python para datos de Visium HD.
Visium HD Spatial Gene Expression ofrece un descubrimiento espacial completo a nivel de célula única.
Los slides tienen áreas de captura con barcodes para una alta resolución.
El análisis de una muestra de cáncer de mama crea un mapa del transcriptoma y identifica tipos celulares.
Se puede explorar y analizar los datos con Space Ranger y Loupe Browser, y hay herramientas en R y Python disponibles.
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