Visium HD Spatial Gene Expression
oferece uma descoberta espacial completa.
Com uma nova tecnologia que combina a análise de transcriptoma completo ao nível de célula única, permite uma cobertura contínua do tecido e oferece dados de alta qualidade, utilizando uma química inovadora e um fluxo de trabalho facilitado pelo Visium CytAssist.
Arquitetura de slides de última geração permite resolução à escala de célula única
Os slides de Visium HD Spatial Gene Expression contêm duas áreas de captura de 6,5 x 6,5 mm, com uma distribuição contínua de oligonucleótidos em cerca de 11 milhões de quadrados de 2 x 2 µm, com códigos de barras específicos, conseguindo uma resolução espacial ao nível de célula única. Os dados são gerados a uma resolução de 2 µm, bem como em múltiplos tamanhos de bin (recomenda-se começar a visualização e análise com o bin de 8 x 8 µm).
A exploração intuitiva de dados acelera a descoberta
- Pode processar os dados de expressão genética espacial de Visium HD com imagens de microscopia de campo claro e de fluorescência utilizando o Space Ranger, um conjunto de pipelines de análise.
- Além disso, é possível visualizar e explorar os dados com o Loupe Browser e continuar a análise com a crescente comunidade de ferramentas desenvolvidas em R e Python para dados de Visium HD.
O Visium HD Spatial Gene Expression oferece uma descoberta espacial completa ao nível de célula única.
Os slides possuem áreas de captura com códigos de barras para uma alta resolução.
A análise de uma amostra de cancro da mama cria um mapa do transcriptoma e identifica tipos celulares.
É possível explorar e analisar os dados com o Space Ranger e o Loupe Browser, e há ferramentas disponíveis em R e Python.
Tens dúvidas?
Contacta com um especialista