Descubre la organización espacial de la expresión génica

La solución Visium de 10x Genomics permite analizar perfiles transcriptómicos de cortes de tejido fresco-congelados (FF)  o previamente fijadas con parafina  (FFPE), con una manipulación sencilla de los tejidos, una detección sensible de los genes y un software fácil de usar para visualizar la expresión génica. De esta manera, Visium proporciona una solución de nueva generación para el estudio de tejidos basada en el ARNm total, la cual permite descubrir nuevos conocimientos de los tejidos, patologías o enfermedades de los mismos, e incluso nuevas aportaciones para la investigación clínica trasnacional.

ALTA RESOLUCIÓN 

Resolución de 1 a 10 células en promedio por spot dependiendo del tipo de tejido

ANÁLISIS DE DATOS OPTIMIZADO

Combina datos histológicos y de expresión génica con un software fácil de usar

CO-DETECCIÓN DE PROTEÍNAS

Combina el análisis espacial del transcriptoma completo con la detección de proteínas.

PERFIL DE SECCIONES DE TEJIDO COMPLETO

No es necesario seleccionar regiones de interés: analiza todo el transcriptoma de una corte completo

DIVERSA COMPATIBILIDAD DE MUESTRAS

Datos demostrados sobre un conjunto diverso de órganos en FFPE (humano y ratón) o en diversas espécies en tejido FF (fresco-congelado)

COMPATIBLE CON CYTASSIST

Ambas soluciones, Visium FF y Visium FFPE son compatibles con CytAssist facilitando flujo de trabajo y aumentando sensibilidad

Visium FF

Solución optimizada para trabajar con tejido fresco-congelado y emebebido en OCT. El tejido es permeabilizado liberando las moléculas de mRNA que son capturadas por los oligos del slide ubicados en diferentes spot con localización conocida. Dichos oligos contienen una secuencia Spatial Barcode la cual permitirá localizar y conocer la procendencia espacial de cada uno de los transcritos a nivel espacial.

Visium FFPE

La solución Visium FFPE de 10x Genomics permite conocer el perfil transcriptómico de tejidos procedentes de bloques de parafina. Testado en un amplio listado de tejidos.  Esta aproximación está basada en sondas específicas tanto para humano como para ratón, siendo las propias sondas las cuales aportan las cola de poliA que será capturada por los oligos del slide.

Visium CytAssist

Con el uso del Visium CytAssist, se puede simplificar el flujo de trabajo de Visium, facilitando la transferencia de sondas transcriptomáticas de un slide  estándar al slide Visium de 10x Genomics. De esta manera, se permite la obtención de perfiles espaciales transcriptómicos completos en toda la sección de tejido y una mayor compatibilidad con las muestras, ya sean frescas congeladas (FF), parafinadas (FFPE) o fijadas – congeladas (Fixed Frozen)

Combina el análisis de todo el transcriptoma del tejido con la detección de proteínas simultaneamente del mismo corte de tejido gracias a la plataforma Visium, consiguiendo así mayor información acerca de la organización tisular.

Realiza ambos análisis utilizando el panel validado por 10x Genomics. Se trata de la única aproximación que te permite tomar imagen previo del tejido, ya sea por tinción con H&E o inmunolfuorescencia.